ZOOM Lite

ZOOM Lite egy következő generációs szekvenálás adatok feltérképezése és vizualizációs szoftverek. Felhasználók bemeneti referencia genomok és Illumina / Solexa rövid olvas fájlokat vagy AB egyszínű helyet olvas fájlokat különböző formátumokban, mint például * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta stb ZOOM kiadja a térképezés eredményeit a rövid olvasható a referencia-sorozatot. ZOOM Lite egy gyors és pontos feltérképezése kernel alapján az újonnan kialakított több egymástól magvak elmélet. Mind egy-end, párosított-end olvas különböző hosszúságú 15bp hogy 240bp lehet kezelni. Bármennyi eltérések és egy beillesztés / törlése különböző hosszúságú az olvasási és célterület a referencia szekvencia megengedett. Egyedülálló módon feltérképezett eredmények vagy a legjobb (top N) eredmények az egyes leolvasott szerint kell jelenteni minimális eltérések és indel hossza. Minőségi pontszámokat hasznosítják, hogy fokozza térképészeti pontossággal. Alapuló feltérképezése kernel, ZOOM Lite lehetővé teszi a felhasználóknak, hogy betöltéséhez helyi olvasási adatok és referencia szekvencia adatok, válassza ki a megfelelő paramétereket, a folyamat nagy mennyiségű adat párhuzamosan közül legfeljebb négy CPU, figyelemmel kíséri az üzemeltetési feladatokat, tárolja a térképezés eredményeit, megtekintheti a grafikonok A feltérképezés eredményeinek és kimeneti leképezés eredménye sem * .BED vagy * .GFF fájlformátumok további felmérése a UCSC böngésző zeneszám adatait. Mapping eredményeket lehet megtekinteni kívánt szinten, az olvasott mélység gráf egy egész kromoszóma részletes sorrendben illesztések között olvas, és a referencia-sorozatot. A felhasználók könnyedén navigálhat a ROI egyszerűen keresztül kattintással és húzással vagy lapozással. ZOOM Lite egy származéka a ZOOM Studio szoftverrel.

Mi az új ebben a kiadásban:

1.5 verzió tartalmazza SAM export formátum, építészet állítsa, jobban kód optimalizálása, kisebb programot bináris mérete, és korszerűsítették dabase engining a jobb teljesítmény érdekében.